Capostipite di una famiglia olandese di incisori e geografi, si stabilì a Londra, dove si fece conoscere anche come costruttore di strumenti scientifici e fonditore di caratteri tipografici. Tornato in Olanda, pubblicò molte carte geografiche, globi, atlanti e le carte di importanti resoconti di viaggio. Ebbe due figli che si distinsero entrambi (soprattutto il maggiore, Jodocus Hondius junior) nell'arte dell'incisione e della pittura.