La sezione interattiva conclude la visita al Museo Galileo con tre sale dedicate all’esplorazione materiale e virtuale di alcuni strumenti galileiani, permettendo ai visitatori di apprezzare quella componente sperimentale che guidò le ricerche di Galileo e che non poteva mancare in un museo dedicato al grande scienziato pisano.

Nella prima sala vengono messe a confronto le antiche concezioni cosmologiche con il nuovo mondo celeste scoperto da Galileo e vengono illustrate le leggi del moto, da quello planetario alla caduta dei gravi. Nella seconda sala viene affrontato il tema della longitudine in rapporto alla misura del tempo ed infine nella terza sono esposti alcuni antichi orologi meccanici. Tutta la sezione offre ai visitatori la possibilità di interagire attraverso modelli funzionanti e applicazioni multimediali fruibili su touchscreen integrati nel percorso. E' possibile così compiere "sensate esperienze" e al tempo stesso soddisfare la domanda su come funzionano gli strumenti scientifici, restituendo una specifica finalità ad oggetti pensati per essere usati.